Στην Κλινική υπάρχουν 17 οργανικές θέσεις ειδικευομένων Παιδιατρικής, 3 ειδικευόμενοι Γενικής Ιατρικής και 2 ειδικευόμενοι Παιδοκαρδιολογίας ((με απόφαση του ΚΕΣΥ (ΦΕΚ236/29-12-1994). Η ειδίκευσή των Παιδιάτρων μπορεί να είναι πλήρης (4 χρόνια) ή μερική, συνέχεια μιάς άλλης Παιδιατρικής Κλινικής του ΕΣΥ. Ολοι οι ειδικευόμενοι για 6 μήνες αποσπώνται σε Μονάδα Εντατικής Παρακολούθησης Νεογνών στο Νοσοκομείο «Παπαγεωργίου» ή στο «Ιπποκράτειο». Οι ειδικευόμενοι της Γενικής Παιδιατρικής εκπαιδεύονται 3 μήνες στην Κλινική ενώ οι ειδικευόμενοι στην Παιδοκαρδιολογία εκπαιδεύονται 3 μήνες.